昌吉回族自治州财政局在州党委、州人民政府领导下，在乌昌财政局业务指导下，负责昌吉州部分项目支出和机动财力的安排使用，以及昌吉州本级行政、事业、企业单位财务工作。职责是：

1、贯彻落实州党委、州人民政府工作部署，负责国家、自治区、乌昌地区财务、行政事业国有资产管理等有关法规、制度和方针政策的组织实施。

2、管理自治州财政专项资金，负责财政专项资金的支出安排和资金拨付。负责财政性资金投资项目的财务管理和工程预、决算审核及资金使用监督。

3、参与研究自治州经济体制改革和企业改革，提出经济和社会发展的意见和建议，配合实施经济体制改革和企业改革的各项措施。参与事业单位改制工作。

4、拟定和执行全州国有资本金基础管理的有关规章制度、管理办法；监督执行《企业财务通则》；负责国有企业国有资产管理工作，监交国有资产收益；组织实施全州国有企业、城镇集体企业股权管理、清产核资、产权交易、资本金权属界定、产权登记。组织查处国有资产流失案件。

5、监督管理州本级行政事业单位国有资产。负责行政事业国有资产产权登记、界定、划转、交易、纠风调处，资产配置、处置、评估和清产核资工作；审批州本级事业单位非经营性资产转经营性资产及州本级行政事业单位非经营性资产出租、出借事项；负责州本级行政事业罚没资产的处置管理；负责将资产处置收益和非经营性资产转经营性资产收益纳入非税收入管理。

6、管理和指导全州会计工作，加强会计监督、规范会计行为，保障会计资料的真实完整，查处各单位违反《会计法》及有关会计法规的案件；组织执行《企业会计准则》、《事业单位会计准则》和分行业会计制度，制定补充规定并贯彻执行；组织和管理会计人员的业务培训和会计从业资格证书；指导和监督注册会计师、注册资产评估师等；负责州本级机关、事业、企业单位的会计事务具体财政审批、审核事项；指导和管理社会审计工作。

 7、组织实施州本级政府采购工作,拟定政府采购管理办法，指导、监督、检查全州政府采购工作。负责州本级党政机关、财政拨款事业单位汽车定编工作。

8、监督财税方针政策、法律法规的执行；检查监督州本级预算征收部门各项预算收入情况和各部门、单位财务执行情况，检查反映财政收支管理中的重大问题，查处各种违反财经纪律案件，提出加强财政管理的政策建议。

9、制定州本级财政干部教育规划；组织管理财政干部培训，加强队伍建设，抓好精神文明建设、党风廉政建设、机关效能建设；负责财政宣传和财政信息工作。

10、承办州党委、州政府和上级主管部门交办的其他事项。